国家重点实验室是国家科技创新体系的重要组成部分，是国家组织高水平基础研究和应用基础研究、聚集和培养优秀科技人才、开展高水平学术交流、科研装备先进的重要基地。其主要任务是针对学科发展前沿和国民经济、社会发展及国家安全的重要科技领域和方向，开展创新性研究。

中国科学院作为主管部门以及与其他部门共同主管共建的国家重点实验室有82个（详细名单略），约占全国学科类国家重点实验室总数的1/3。目前，按照党中央、国务院统一部署，国家重点实验室体系正在重组中。