国家工程技术研究中心由科技部根据需要统筹规划建设，旨在建立我国社会主义市场经济体制中，探索科技与经济结合的新途径，加强科技成果向生产力转化的中心环节，缩短成果转化的周期。同时，面向企业规模生产的实际需要，提高现有科技成果的成熟性、配套性和工程化水平，加速企业生产技术改造，促进产品更新换代，为企业引进、消化和吸收国外先进技术提供基本技术支撑。

根据科技部、财政部、国家发展改革委三部门于2017年联合印发的《国家科技创新基地优化整合方案》有关要求，对现由科技部管理的国家工程技术研究中心加强评估考核和多渠道优化整合，符合条件的纳入国家技术创新中心等管理，科技部不再批复新建国家工程技术研究中心。目前，中国科学院院属单位作为依托单位的国家工程技术研究中心有19个（详细名单略）。