负责院规划体系建设、院发展规划的制定实施；负责重点实验室等科研平台的规划布局与评估验收；负责院部署重大科技项目的立项组织与评估验收；负责战略研究和综合性改革的组织协调；承担科技评价与奖励工作；承担院规章制度建设协调管理工作；负责与地方科技合作的组织协调；承担院参与国家科技创新中心及综合性国家科学中心建设的协调与管理工作；负责知识产权管理，促进科技成果转移转化；负责综合统计工作；承担院学术委员会办公室工作等。

内设处室：综合处、规划与评估处（奖励办）、重点实验室处、重大项目协调管理处、战略研究与改革处、科技合作处（院科创办）、知识产权管理处。